Осторожно, возможен спойлер:
Посередине киносюжета «Птичьего короба» располагается летопись о выживании в условиях постапокалипсиса. Главная героиня, Малори (Сандра Буллок), вместе с двумя детьми старается найти безопасное пространство в мире, где люди подвергаются действию таинственной силы, принуждающей их совершать самоубийство. Фильм начинается с того, что Малори готовится к страшному путешествию, при этом она завязывает детям глаза, чтобы защитить их от увиденного. Действие происходит в неопределенное время, когда общество уже разрушено.
Сюжет разворачивается по двум линиям. Одна из них показывает, как Малори пытается выбраться с детьми, передвигаясь по рекам и лесам, полным угроз. Она сталкивается с множеством препятствий, начиная от встречи с другими выжившими, которые могут быть как союзниками, так и врагами. Вторая линия рассказывает о событиях, произошедших до катастрофы. Малори встречает таких персонажей, как Том (Треванте Роудс) и Дэн (Дэниел Мальдунг), которые помогают ей разобраться в происходящем и осознать масштабы угрозы.
Малори и ее спутники начинают осознавать, что, несмотря на опасности, они должны продолжать двигаться вперед. Каждый шаг становится испытанием, и вскоре они понимают, что доверие становится их единственным спасением. Они близки к разгадке того, что произошло, но цена высока - выживание требует жертв и смелости.